J'ai eu le même problème (ne fonctionnant pas avec la base de données Django et PostGres).
Finalement, j'ai réussi à résoudre ce problème avec la solution d'Amir. J'ai ajouté les référentiels de dl-cdn.alpinelinux.org selon https://github.com/appropriate/docker-postgis/blob/master/Dockerfile.alpine.template. La partie cruciale consistait à exécuter geos-config après l'implémentation de geos-dev et de geos. Après cela, j'ai installé les modules python, y compris les pandas. À la section de nettoyage, .build-deps est ignoré comme indiqué.
C'est la partie de mon Dockerfile qui a fait l'affaire :
...
RUN apk --update add build-base libxslt-dev
RUN apk add --virtual .build-deps \
--repository http://dl-cdn.alpinelinux.org/alpine/edge/testing \
--repository http://dl-cdn.alpinelinux.org/alpine/edge/main \
gcc libc-dev geos-dev geos && \
runDeps="$(scanelf --needed --nobanner --recursive /usr/local \
| awk '{ gsub(/,/, "\nso:", $2); print "so:" $2 }' \
| xargs -r apk info --installed \
| sort -u)" && \
apk add --virtual .rundeps $runDeps
RUN geos-config --cflags
RUN pip install --disable-pip-version-check -r requirements.txt
RUN apk del build-base python3-dev && \
rm -rf /var/cache/apk/*
...
Au fait, j'ai également essayé la solution fournie sur https://github.com/calendar42/docker-python-geos/blob/master/Dockerfile. Mais cela n'a pas fonctionné pour moi.
